scripts for 16M reductions

run_corrJF.sh

@@ -0,0 +1,10 @@
+#! /bin/bash
+
+acq=$2
+echo "$acq"
+
+source /sf/daq/source-conda
+conda activate /sf/alvra/applications/miniconda3/envs/alvra-apo
+#conda activate alvra-analysis
+
+python /sf/alvra/code/apo_scripts/correlationsJF.py -i $acq

run_radial.sh

@@ -0,0 +1,10 @@
+#! /bin/bash
+
+acq=$2
+echo "$acq"
+
+source /sf/daq/source-conda
+conda activate /sf/alvra/applications/miniconda3/envs/alvra-apo
+#conda activate alvra-analysis
+
+python /sf/alvra/code/apo_scripts/quick_radial_roi.py -i $acq

run_roi_intensity.sh

@@ -0,0 +1,10 @@
+#! /bin/bash
+
+acq=$2
+echo "$acq"
+
+source /sf/daq/source-conda
+conda activate /sf/alvra/applications/miniconda3/envs/alvra-apo
+#conda activate alvra-analysis
+
+python /sf/alvra/code/apo_scripts/roi_intensity.py -i $acq