added mill dir
This commit is contained in:
@ -30,6 +30,13 @@ else
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FILESTREAM=stream.stream
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fi
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if [ $# -ge 5 ]
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then
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MILLDIR=$5
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else
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MILLDIR=unknown-mill
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fi
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# list of indexing methods : xgandalf-latt-cell,asdf-latt-cell,dirax-latt-cell,mosflm-latt-cell
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# but usually all is indexed by xgandalf (99.99%)
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@ -46,7 +53,7 @@ then
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||||
--peaks=peakfinder8 \
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||||
--integration=rings-grad \
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||||
--tolerance=10.0,10.0,10.0,2,3,2 \
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||||
--threshold=2000 \
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||||
--threshold=10 \
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||||
--min-snr=5 \
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||||
--int-radius=2,3,6 \
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||||
-j ${NP} \
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||||
@ -54,8 +61,10 @@ then
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||||
--no-retry \
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||||
--check-peaks \
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||||
--max-res=3000 \
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||||
--min-pix-count=1 \
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||||
--local-bg-radius=4
|
||||
--min-pix-count=2 \
|
||||
--local-bg-radius=4 \
|
||||
--mille \
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||||
--mille-dir=${MILLDIR}
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||||
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||||
else
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||||
@ -66,7 +75,7 @@ else
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||||
--peaks=peakfinder8 \
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||||
--integration=rings-grad \
|
||||
--tolerance=10.0,10.0,10.0,2,2,2 \
|
||||
--threshold=2000 \
|
||||
--threshold=10 \
|
||||
--min-snr=5 \
|
||||
--int-radius=2,3,6 \
|
||||
-j ${NP} \
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||||
@ -74,8 +83,12 @@ else
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||||
--no-retry \
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||||
--check-peaks \
|
||||
--max-res=3000 \
|
||||
--min-pix-count=1 \
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||||
--local-bg-radius=4
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||||
--min-pix-count=2 \
|
||||
--local-bg-radius=4 \
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||||
--mille \
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--mille-dir=${MILLDIR}
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fi
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chmod -R g+rwx ${MILLDIR}
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Reference in New Issue
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