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# Example of using ImageJ functionalities through ijutils.
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from ijutils import *
import java.awt.Color as Color

#Image Loading
ip = load_image("{images}/test2.png", title="Image")

aux = ip.duplicate()
aux.show()
grayscale(aux)
gaussian_blur(aux); aux.repaintWindow()

#invert(aux); aux.repaintWindow()
#smooth(aux); aux.repaintWindow()
#sharpen(aux); aux.repaintWindow()


#Histogram
plot(get_histogram(aux))




auto_threshold(aux)
invert(aux)
binary_fill_holes(aux); aux.repaintWindow()
#binary_fill_holes(aux)
#aux.show()
(results,output_img)=analyse_particles(aux, 400,1000, 
            fill_holes = False, exclude_edges = True,print_table=True,
            output_image = "outlines", minCirc = 0.0, maxCirc = 1.0)
output_img.show()