FIX: merlin env now software dependent
This commit is contained in:
Germann Elsa Sylvia
900
env/merlin/all/spack.yaml
vendored
Normal file
900
env/merlin/all/spack.yaml
vendored
Normal file
@ -0,0 +1,900 @@
|
|||||||
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spack:
|
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|
concretizer:
|
||||||
|
unify: when_possible
|
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|
definitions:
|
||||||
|
- mpi:
|
||||||
|
- ^openmpi@4.1.4%gcc@8.3.0+cuda fabrics=ucx,xpmem,knem,ofi,cma,hcoll schedulers=slurm
|
||||||
|
+pmi ^ucx@1.13.0 ^cuda@11.5.1 ^slurm@21-08-8-2 ^hwloc@2.7.1 ^knem@1.1.4 ^xpmem@2.6.5-36
|
||||||
|
^pmix@4.1.2
|
||||||
|
- python:
|
||||||
|
- ^py-numpy@1.19.5%gcc@8.3.0 ^python@3.6.13%gcc@8.3.0
|
||||||
|
- blas:
|
||||||
|
- ^openblas%gcc@8.3.0
|
||||||
|
include:
|
||||||
|
- sysconfigs/config.yaml
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||||||
|
- sysconfigs/compilers.yaml
|
||||||
|
- sysconfigs/packages.yaml
|
||||||
|
#>>> modules.yaml
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||||||
|
modules:
|
||||||
|
Batchsystem:
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||||||
|
use_view: Batchsystem
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||||||
|
arch_folder: false
|
||||||
|
enable:
|
||||||
|
- tcl
|
||||||
|
roots:
|
||||||
|
tcl: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/Batchsystem
|
||||||
|
tcl:
|
||||||
|
blacklist_implicits: true
|
||||||
|
include:
|
||||||
|
- slurm
|
||||||
|
exclude:
|
||||||
|
- '%clang@12.0.0'
|
||||||
|
- '%dpcpp@2022.1.0'
|
||||||
|
- '%gcc@8.3.0'
|
||||||
|
- '%gcc@12.1.0'
|
||||||
|
- '%intel@2021.6.0'
|
||||||
|
- '%nvhpc@21.5'
|
||||||
|
- '%oneapi@2022.1.0'
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
autoload: direct
|
||||||
|
conflict:
|
||||||
|
- '{name}'
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
prepend_path:
|
||||||
|
MODULEPATH: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/Batchsystem
|
||||||
|
set:
|
||||||
|
${PACKAGE}_INCLUDE_DIR: '{prefix}/include'
|
||||||
|
${PACKAGE}_LIBRARY_DIR: '{prefix}/lib'
|
||||||
|
slurm:
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
prepend_path:
|
||||||
|
SLURM_CONF: /etc/slurm/slurm.conf
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
all: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}
|
||||||
|
^mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}
|
||||||
|
~mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_serial/{version}
|
||||||
|
threads=openmp: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_OMP/{version}
|
||||||
|
MPI:
|
||||||
|
use_view: MPI
|
||||||
|
arch_folder: false
|
||||||
|
enable:
|
||||||
|
- tcl
|
||||||
|
roots:
|
||||||
|
tcl: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/MPI
|
||||||
|
tcl:
|
||||||
|
blacklist_implicits: true
|
||||||
|
include:
|
||||||
|
- amrex
|
||||||
|
- boxlib
|
||||||
|
- cp2k
|
||||||
|
- cpmd
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|
- elegant
|
||||||
|
- elpa
|
||||||
|
- fftw
|
||||||
|
- gromacs
|
||||||
|
- lammps
|
||||||
|
- astra
|
||||||
|
exclude:
|
||||||
|
- '%clang@12.0.0'
|
||||||
|
- '%dpcpp@2022.1.0'
|
||||||
|
- '%gcc@8.3.0'
|
||||||
|
- '%gcc@12.1.0'
|
||||||
|
- '%intel@2021.6.0'
|
||||||
|
- '%nvhpc@21.5'
|
||||||
|
- '%oneapi@2022.1.0'
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
autoload: direct
|
||||||
|
conflict:
|
||||||
|
- '{name}'
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
prepend_path:
|
||||||
|
MODULEPATH: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/MPI
|
||||||
|
set:
|
||||||
|
${PACKAGE}_INCLUDE_DIR: '{prefix}/include'
|
||||||
|
${PACKAGE}_LIBRARY_DIR: '{prefix}/lib'
|
||||||
|
${PACKAGE}_VERSION: '{version}'
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
all: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}
|
||||||
|
^mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}
|
||||||
|
~mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_serial/{version}
|
||||||
|
threads=openmp: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_OMP/{version}
|
||||||
|
Compiler:
|
||||||
|
use_view: Compiler
|
||||||
|
arch_folder: false
|
||||||
|
enable:
|
||||||
|
- tcl
|
||||||
|
roots:
|
||||||
|
tcl: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/Compiler
|
||||||
|
tcl:
|
||||||
|
blacklist_implicits: true
|
||||||
|
include:
|
||||||
|
- atlas
|
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|
- clapack
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|
- boost
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|
- clhep
|
||||||
|
- eigen
|
||||||
|
- geant4
|
||||||
|
- googletest
|
||||||
|
- gsl
|
||||||
|
- intel-oneapi-mpi
|
||||||
|
- kokkos
|
||||||
|
- libint
|
||||||
|
- libxc
|
||||||
|
- libxsmm
|
||||||
|
- mpich
|
||||||
|
- openblas
|
||||||
|
- openmpi
|
||||||
|
- root
|
||||||
|
- superlu
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||||||
|
- vtk
|
||||||
|
exclude:
|
||||||
|
- '%clang@12.0.0'
|
||||||
|
- '%dpcpp@2022.1.0'
|
||||||
|
- '%gcc@8.3.0'
|
||||||
|
- '%gcc@12.1.0'
|
||||||
|
- '%intel@2021.6.0'
|
||||||
|
- '%nvhpc@21.5'
|
||||||
|
- '%oneapi@2022.1.0'
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
autoload: direct
|
||||||
|
conflict:
|
||||||
|
- '{name}'
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
set:
|
||||||
|
${PACKAGE}_INCLUDE_DIR: '{prefix}/include'
|
||||||
|
${PACKAGE}_LIBRARY_DIR: '{prefix}/lib'
|
||||||
|
${PACKAGE}_VERSION: '{version}'
|
||||||
|
intel-oneapi-mpi:
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
prepend_path:
|
||||||
|
MODULEPATH: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/MPI
|
||||||
|
set:
|
||||||
|
I_MPI_CXX: mpiicpc
|
||||||
|
I_MPI_F77: mpiifort
|
||||||
|
I_MPI_F90: mpiifort
|
||||||
|
I_MPI_FC: mpiifort
|
||||||
|
I_MPI_ICC: mpiicc
|
||||||
|
MPIEXEC: mpiexec.hydra
|
||||||
|
MPIFC: mpiifort
|
||||||
|
MPIFORTRAN: mpiifort
|
||||||
|
MPIRUN: mpirun
|
||||||
|
mpich:
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
prepend_path:
|
||||||
|
MODULEPATH: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/MPI
|
||||||
|
set:
|
||||||
|
MPIEXEC: ${prefix}/bin/mpiexec
|
||||||
|
MPIFC: ${prefix}/bin/mpif90
|
||||||
|
MPIFORTRAN: ${prefix}/bin/mpif90
|
||||||
|
MPIRUN: ${prefix}/bin/mpirun
|
||||||
|
openblas:
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
set:
|
||||||
|
BLASLIB: ${prefix}/libopenblas.a
|
||||||
|
openmpi:
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
prepend_path:
|
||||||
|
MODULEPATH: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/MPI
|
||||||
|
set:
|
||||||
|
MPIEXEC: ${prefix}/bin/mpiexec
|
||||||
|
MPIFC: ${prefix}/bin/mpif90
|
||||||
|
MPIFORTRAN: ${prefix}/bin/mpif90
|
||||||
|
MPIRUN: ${prefix}/bin/mpirun
|
||||||
|
root:
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
set:
|
||||||
|
ROOTSYS: ${prefix}
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
all: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}
|
||||||
|
^mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}
|
||||||
|
~mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_serial/{version}
|
||||||
|
threads=openmp: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_OMP/{version}
|
||||||
|
Cuda:
|
||||||
|
use_view: Cuda
|
||||||
|
arch_folder: false
|
||||||
|
enable:
|
||||||
|
- tcl
|
||||||
|
roots:
|
||||||
|
tcl: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/cuda
|
||||||
|
tcl:
|
||||||
|
blacklist_implicits: true
|
||||||
|
include:
|
||||||
|
- cuda
|
||||||
|
exclude:
|
||||||
|
- '%clang@12.0.0'
|
||||||
|
- '%dpcpp@2022.1.0'
|
||||||
|
- '%gcc@8.3.0'
|
||||||
|
- '%gcc@12.1.0'
|
||||||
|
- '%intel@2021.6.0'
|
||||||
|
- '%nvhpc@21.5'
|
||||||
|
- '%oneapi@2022.1.0'
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
autoload: direct
|
||||||
|
conflict:
|
||||||
|
- '{name}'
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
prepend_path:
|
||||||
|
${PACKAGE}_PATH: '{prefix}'
|
||||||
|
LIBRARY_PATH: '{prefix}/targets/x86_64-linux/lib/stubs'
|
||||||
|
set:
|
||||||
|
${PACKAGE}_DIR: '{prefix}'
|
||||||
|
${PACKAGE}_INCLUDE_DIR: '{prefix}/include'
|
||||||
|
${PACKAGE}_LIBRARY_DIR: '{prefix}/lib'
|
||||||
|
${PACKAGE}_PATH: '{prefix}'
|
||||||
|
${PACKAGE}_VERSION: '{version}'
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
all: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}
|
||||||
|
^mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}
|
||||||
|
~mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_serial/{version}
|
||||||
|
threads=openmp: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_OMP/{version}
|
||||||
|
EM:
|
||||||
|
use_view: EM
|
||||||
|
arch_folder: false
|
||||||
|
enable:
|
||||||
|
- tcl
|
||||||
|
roots:
|
||||||
|
tcl: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/EM
|
||||||
|
tcl:
|
||||||
|
blacklist_implicits: true
|
||||||
|
include:
|
||||||
|
- cistem
|
||||||
|
- ctffind
|
||||||
|
- motioncor2
|
||||||
|
- relion
|
||||||
|
- unblur
|
||||||
|
exclude:
|
||||||
|
- '%clang@12.0.0'
|
||||||
|
- '%dpcpp@2022.1.0'
|
||||||
|
- '%gcc@8.3.0'
|
||||||
|
- '%gcc@12.1.0'
|
||||||
|
- '%intel@2021.6.0'
|
||||||
|
- '%nvhpc@21.5'
|
||||||
|
- '%oneapi@2022.1.0'
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
autoload: direct
|
||||||
|
conflict:
|
||||||
|
- '{name}'
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
prepend_path:
|
||||||
|
MODULEPATH: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/EM
|
||||||
|
set:
|
||||||
|
${PACKAGE}_INCLUDE_DIR: '{prefix}/include'
|
||||||
|
${PACKAGE}_LIBRARY_DIR: '{prefix}/lib'
|
||||||
|
${PACKAGE}_VERSION: '{version}'
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
all: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}
|
||||||
|
^mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}
|
||||||
|
~mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_serial/{version}
|
||||||
|
threads=openmp: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_OMP/{version}
|
||||||
|
HDF5:
|
||||||
|
use_view: HDF5
|
||||||
|
arch_folder: false
|
||||||
|
enable:
|
||||||
|
- tcl
|
||||||
|
roots:
|
||||||
|
tcl: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/HDF5
|
||||||
|
tcl:
|
||||||
|
blacklist_implicits: true
|
||||||
|
include:
|
||||||
|
- alps
|
||||||
|
- h5hut+mpi
|
||||||
|
- hdf5-blosc
|
||||||
|
- ioapi
|
||||||
|
- hdf5+mpi
|
||||||
|
- netcdf-c
|
||||||
|
- netcdf-fortran
|
||||||
|
- netcdf-c
|
||||||
|
- trilinos
|
||||||
|
exclude:
|
||||||
|
- '%clang@12.0.0'
|
||||||
|
- '%dpcpp@2022.1.0'
|
||||||
|
- '%gcc@8.3.0'
|
||||||
|
- '%gcc@12.1.0'
|
||||||
|
- '%intel@2021.6.0'
|
||||||
|
- '%nvhpc@21.5'
|
||||||
|
- '%oneapi@2022.1.0'
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
autoload: direct
|
||||||
|
conflict:
|
||||||
|
- '{name}'
|
||||||
|
- HDF5_serial
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
prepend_path:
|
||||||
|
MODULEPATH: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/HDF5
|
||||||
|
set:
|
||||||
|
${PACKAGE}_ROOT: '{prefix}'
|
||||||
|
${PACKAGE}_LIBRARY_DIR: '{prefix}/lib'
|
||||||
|
${PACKAGE}_INCLUDE_DIR: '{prefix}/include'
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
all: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}
|
||||||
|
^mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}
|
||||||
|
~mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_serial/{version}
|
||||||
|
threads=openmp: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_OMP/{version}
|
||||||
|
HDF5_serial:
|
||||||
|
use_view: HDF5_serial
|
||||||
|
arch_folder: false
|
||||||
|
enable:
|
||||||
|
- tcl
|
||||||
|
roots:
|
||||||
|
tcl: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/HDF5_serial
|
||||||
|
tcl:
|
||||||
|
blacklist_implicits: true
|
||||||
|
include:
|
||||||
|
- hdf5~mpi
|
||||||
|
- h5hut~mpi
|
||||||
|
- ncview
|
||||||
|
exclude:
|
||||||
|
- '%clang@12.0.0'
|
||||||
|
- '%dpcpp@2022.1.0'
|
||||||
|
- '%gcc@8.3.0'
|
||||||
|
- '%gcc@12.1.0'
|
||||||
|
- '%intel@2021.6.0'
|
||||||
|
- '%nvhpc@21.5'
|
||||||
|
- '%oneapi@2022.1.0'
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
autoload: direct
|
||||||
|
conflict:
|
||||||
|
- '{name}'
|
||||||
|
- HDF5_serial
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
prepend_path:
|
||||||
|
MODULEPATH: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/HDF5_serial
|
||||||
|
set:
|
||||||
|
${PACKAGE}_DIR: '{prefix}'
|
||||||
|
${PACKAGE}_HOME: '{prefix}'
|
||||||
|
${PACKAGE}_INCLUDE_DIR: '{prefix}/include'
|
||||||
|
${PACKAGE}_LIBRARY_DIR: '{prefix}/lib64'
|
||||||
|
${PACKAGE}_PREFIX: '{prefix}'
|
||||||
|
${PACKAGE}_ROOT: '{prefix}'
|
||||||
|
${PACKAGE}_VERSION: '{version}'
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
all: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}
|
||||||
|
^mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}
|
||||||
|
~mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_serial/{version}
|
||||||
|
threads=openmp: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_OMP/{version}
|
||||||
|
Librairies:
|
||||||
|
use_view: Librairies
|
||||||
|
arch_folder: false
|
||||||
|
enable:
|
||||||
|
- tcl
|
||||||
|
roots:
|
||||||
|
tcl: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/Librairies
|
||||||
|
tcl:
|
||||||
|
blacklist_implicits: true
|
||||||
|
include:
|
||||||
|
- alsa-lib
|
||||||
|
- gdrcopy
|
||||||
|
- giflib
|
||||||
|
- gmp
|
||||||
|
- hwloc
|
||||||
|
- isl
|
||||||
|
- knem
|
||||||
|
- libtasn1
|
||||||
|
- mpc
|
||||||
|
- mpfr
|
||||||
|
- nettle
|
||||||
|
- pmix
|
||||||
|
- ucx
|
||||||
|
- udunits
|
||||||
|
- wxwidgets
|
||||||
|
- x264
|
||||||
|
- zlib
|
||||||
|
exclude:
|
||||||
|
- '%clang@12.0.0'
|
||||||
|
- '%dpcpp@2022.1.0'
|
||||||
|
- '%gcc@8.3.0'
|
||||||
|
- '%gcc@12.1.0'
|
||||||
|
- '%intel@2021.6.0'
|
||||||
|
- '%nvhpc@21.5'
|
||||||
|
- '%oneapi@2022.1.0'
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
autoload: direct
|
||||||
|
conflict:
|
||||||
|
- '{name}'
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
prepend_path:
|
||||||
|
MODULEPATH: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/Librairies
|
||||||
|
set:
|
||||||
|
${PACKAGE}_INCLUDE_DIR: '{prefix}/include'
|
||||||
|
${PACKAGE}_LIBRARY_DIR: '{prefix}/lib'
|
||||||
|
${PACKAGE}_VERSION: '{version}'
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
all: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}
|
||||||
|
^mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}
|
||||||
|
~mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_serial/{version}
|
||||||
|
threads=openmp: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_OMP/{version}
|
||||||
|
MX:
|
||||||
|
use_view: MX
|
||||||
|
arch_folder: false
|
||||||
|
enable:
|
||||||
|
- tcl
|
||||||
|
roots:
|
||||||
|
tcl: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/MX
|
||||||
|
tcl:
|
||||||
|
blacklist_implicits: true
|
||||||
|
include:
|
||||||
|
- cbflib
|
||||||
|
- lz4
|
||||||
|
- openbabel
|
||||||
|
- visit
|
||||||
|
exclude:
|
||||||
|
- '%clang@12.0.0'
|
||||||
|
- '%dpcpp@2022.1.0'
|
||||||
|
- '%gcc@8.3.0'
|
||||||
|
- '%gcc@12.1.0'
|
||||||
|
- '%intel@2021.6.0'
|
||||||
|
- '%nvhpc@21.5'
|
||||||
|
- '%oneapi@2022.1.0'
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
autoload: direct
|
||||||
|
conflict:
|
||||||
|
- '{name}'
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
prepend_path:
|
||||||
|
MODULEPATH: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/MX
|
||||||
|
set:
|
||||||
|
${PACKAGE}_INCLUDE_DIR: '{prefix}/include'
|
||||||
|
${PACKAGE}_LIBRARY_DIR: '{prefix}/lib'
|
||||||
|
${PACKAGE}_VERSION: '{version}'
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
all: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}
|
||||||
|
^mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}
|
||||||
|
~mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_serial/{version}
|
||||||
|
threads=openmp: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_OMP/{version}
|
||||||
|
Programming:
|
||||||
|
use_view: Programming
|
||||||
|
arch_folder: false
|
||||||
|
enable:
|
||||||
|
- tcl
|
||||||
|
roots:
|
||||||
|
tcl: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/Programming
|
||||||
|
tcl:
|
||||||
|
blacklist_implicits: true
|
||||||
|
include:
|
||||||
|
- autoconf
|
||||||
|
- automake
|
||||||
|
- binutils
|
||||||
|
- bison
|
||||||
|
- cmake
|
||||||
|
- erlang
|
||||||
|
- gcc
|
||||||
|
- go
|
||||||
|
- intel
|
||||||
|
- openjdk
|
||||||
|
- julia
|
||||||
|
- libtool
|
||||||
|
- lua
|
||||||
|
- m4
|
||||||
|
- nasm
|
||||||
|
- perl
|
||||||
|
- nvhpc+mpi
|
||||||
|
- python
|
||||||
|
- py-tensorflow
|
||||||
|
- qt
|
||||||
|
- r
|
||||||
|
- tcl
|
||||||
|
- tk
|
||||||
|
exclude:
|
||||||
|
- '%clang@12.0.0'
|
||||||
|
- '%dpcpp@2022.1.0'
|
||||||
|
- '%gcc@8.3.0'
|
||||||
|
- '%gcc@12.1.0'
|
||||||
|
- '%intel@2021.6.0'
|
||||||
|
- '%nvhpc@21.5'
|
||||||
|
- '%oneapi@2022.1.0'
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
autoload: direct
|
||||||
|
conflict:
|
||||||
|
- '{name}'
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
prepend_path:
|
||||||
|
MODULEPATH: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/Programming
|
||||||
|
set:
|
||||||
|
${PACKAGE}_INCLUDE_DIR: '{prefix}/include'
|
||||||
|
${PACKAGE}_LIBRARY_DIR: '{prefix}/lib'
|
||||||
|
${PACKAGE}_VERSION: '{version}'
|
||||||
|
nvhpc:
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
set:
|
||||||
|
ARCH_VERSION: $NVARCH/'$env(PGI_VERSION)'
|
||||||
|
CPP: '{prefix}/$ARCH_VERSION/compilers/bin/nvprepro'
|
||||||
|
F90: '{prefix}/$ARCH_VERSION/compilers/bin/pgf90'
|
||||||
|
F95: '{prefix}/$ARCH_VERSION/compilers/bin/pgf95'
|
||||||
|
FORTRAN: '{prefix}/$ARCH_VERSION/compilers/bin/pgfortran'
|
||||||
|
NVARCH: '{arch}'
|
||||||
|
NVCOMPILERS: '{prefix}'
|
||||||
|
PGI: '{prefix}'
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
all: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}
|
||||||
|
^mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}
|
||||||
|
~mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_serial/{version}
|
||||||
|
threads=openmp: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_OMP/{version}
|
||||||
|
System:
|
||||||
|
use_view: System
|
||||||
|
arch_folder: false
|
||||||
|
enable:
|
||||||
|
- tcl
|
||||||
|
roots:
|
||||||
|
tcl: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/System
|
||||||
|
tcl:
|
||||||
|
blacklist_implicits: true
|
||||||
|
include:
|
||||||
|
- bash
|
||||||
|
- filebench
|
||||||
|
- ior
|
||||||
|
- mdtest
|
||||||
|
- nmap
|
||||||
|
- patchelf
|
||||||
|
- unison
|
||||||
|
exclude:
|
||||||
|
- '%clang@12.0.0'
|
||||||
|
- '%dpcpp@2022.1.0'
|
||||||
|
- '%gcc@8.3.0'
|
||||||
|
- '%gcc@12.1.0'
|
||||||
|
- '%intel@2021.6.0'
|
||||||
|
- '%nvhpc@21.5'
|
||||||
|
- '%oneapi@2022.1.0'
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
autoload: direct
|
||||||
|
conflict:
|
||||||
|
- '{name}'
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
prepend_path:
|
||||||
|
MODULEPATH: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/System
|
||||||
|
set:
|
||||||
|
${PACKAGE}_INCLUDE_DIR: '{prefix}/include'
|
||||||
|
${PACKAGE}_LIBRARY_DIR: '{prefix}/lib'
|
||||||
|
${PACKAGE}_VERSION: '{version}'
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
all: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}
|
||||||
|
^mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}
|
||||||
|
~mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_serial/{version}
|
||||||
|
threads=openmp: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_OMP/{version}
|
||||||
|
Tools:
|
||||||
|
use_view: Tools
|
||||||
|
arch_folder: false
|
||||||
|
enable:
|
||||||
|
- tcl
|
||||||
|
roots:
|
||||||
|
tcl: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/Tools
|
||||||
|
tcl:
|
||||||
|
blacklist_implicits: true
|
||||||
|
include:
|
||||||
|
- aria2
|
||||||
|
- asciidoc
|
||||||
|
- coreutils
|
||||||
|
- emacs
|
||||||
|
- ffmpeg
|
||||||
|
- gaussian
|
||||||
|
- gettext
|
||||||
|
- git
|
||||||
|
- global
|
||||||
|
- gnupg
|
||||||
|
- gnuplot
|
||||||
|
- gnutls
|
||||||
|
- hdfview
|
||||||
|
- krb5
|
||||||
|
- kubernetes
|
||||||
|
- namd
|
||||||
|
- ncview
|
||||||
|
- openjpeg
|
||||||
|
- openssl
|
||||||
|
- orca
|
||||||
|
- paraview
|
||||||
|
- texlive
|
||||||
|
- tmux
|
||||||
|
- uncrustify
|
||||||
|
- vim
|
||||||
|
- visit
|
||||||
|
- xmlto
|
||||||
|
- xz
|
||||||
|
exclude:
|
||||||
|
- '%clang@12.0.0'
|
||||||
|
- '%dpcpp@2022.1.0'
|
||||||
|
- '%gcc@8.3.0'
|
||||||
|
- '%gcc@12.1.0'
|
||||||
|
- '%intel@2021.6.0'
|
||||||
|
- '%nvhpc@21.5'
|
||||||
|
- '%oneapi@2022.1.0'
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
autoload: direct
|
||||||
|
conflict:
|
||||||
|
- '{name}'
|
||||||
|
environment:
|
||||||
|
prepend_path:
|
||||||
|
MODULEPATH: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/Tools
|
||||||
|
set:
|
||||||
|
${PACKAGE}_INCLUDE_DIR: '{prefix}/include'
|
||||||
|
${PACKAGE}_LIBRARY_DIR: '{prefix}/lib'
|
||||||
|
${PACKAGE}_VERSION: '{version}'
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
all: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}
|
||||||
|
^mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}
|
||||||
|
~mpi: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_serial/{version}
|
||||||
|
threads=openmp: modulefiles/{compiler.name}/{compiler.version}/{name}_OMP/{version}
|
||||||
|
prefix_inspections:
|
||||||
|
? ''
|
||||||
|
: - CMAKE_PREFIX_PATH
|
||||||
|
bin:
|
||||||
|
- PATH
|
||||||
|
include:
|
||||||
|
- C_INCLUDE_PATH
|
||||||
|
- CPLUS_INCLUDE_PATH
|
||||||
|
lib:
|
||||||
|
- LIBRARY_PATH
|
||||||
|
- LD_LIBRARY_PATH
|
||||||
|
lib/pkgconfig:
|
||||||
|
- PKG_CONFIG_PATH
|
||||||
|
lib64:
|
||||||
|
- LIBRARY_PATH
|
||||||
|
- LD_LIBRARY_PATH
|
||||||
|
lib64/pkgconfig:
|
||||||
|
- PKG_CONFIG_PATH
|
||||||
|
man:
|
||||||
|
- MANPATH
|
||||||
|
share/aclocal:
|
||||||
|
- ACLOCAL_PATH
|
||||||
|
share/man:
|
||||||
|
- MANPATH
|
||||||
|
share/pkgconfig:
|
||||||
|
- PKG_CONFIG_PATH
|
||||||
|
#<<<
|
||||||
|
specs:
|
||||||
|
# - matrix:
|
||||||
|
# - [alps, geant4]
|
||||||
|
# - ['%gcc@8.3.0']
|
||||||
|
# - [$mpi]
|
||||||
|
# - [$blas]
|
||||||
|
# - [^boost@1.63.0+python+numpy cxxstd=11 +icu ^icu4c cxxstd=11]
|
||||||
|
# - [$python]
|
||||||
|
# - matrix:
|
||||||
|
# - [gromacs, h5hut+mpi, lammps, visit]
|
||||||
|
# - ['%gcc@12.1.0']
|
||||||
|
# - [$mpi]
|
||||||
|
# - [$blas]
|
||||||
|
# - [$python]
|
||||||
|
# - matrix:
|
||||||
|
# - [cp2k@9.1]
|
||||||
|
# - ['%oneapi']
|
||||||
|
- matrix:
|
||||||
|
- [relion +cuda]
|
||||||
|
- ['%nvhpc']
|
||||||
|
- [^openmpi%nvhpc]
|
||||||
|
- [^openblas]
|
||||||
|
- [^llvm%gcc@8.3.0]
|
||||||
|
view:
|
||||||
|
Batchsystem:
|
||||||
|
root: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/Batchsystem
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
^mpi: '{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
all: '{name}/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
~mpi: '{name}_serial/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
threads=openmp: '{name}_OMP/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
select:
|
||||||
|
- slurm
|
||||||
|
link_type: symlink
|
||||||
|
Compiler:
|
||||||
|
root: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/Compiler
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
^mpi: '{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
all: '{name}/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
~mpi: '{name}_serial/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
threads=openmp: '{name}_OMP/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
select:
|
||||||
|
- atlas
|
||||||
|
- clapack
|
||||||
|
- boost
|
||||||
|
- clhep
|
||||||
|
- eigen
|
||||||
|
- geant4
|
||||||
|
- googletest
|
||||||
|
- gsl
|
||||||
|
- intel-oneapi-mpi
|
||||||
|
- kokkos
|
||||||
|
- libint
|
||||||
|
- libxc
|
||||||
|
- libxsmm
|
||||||
|
- mpich
|
||||||
|
- openblas
|
||||||
|
- openmpi
|
||||||
|
- root
|
||||||
|
- superlu
|
||||||
|
- vtk
|
||||||
|
link_type: symlink
|
||||||
|
Cuda:
|
||||||
|
root: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/cuda
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
^mpi: '{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
all: '{name}/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
~mpi: '{name}_serial/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
threads=openmp: '{name}_OMP/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
select:
|
||||||
|
- cuda
|
||||||
|
link_type: symlink
|
||||||
|
EM:
|
||||||
|
root: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/EM
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
^mpi: '{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
all: '{name}/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
~mpi: '{name}_serial/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
threads=openmp: '{name}_OMP/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
select:
|
||||||
|
- cistem
|
||||||
|
- ctffind
|
||||||
|
- motioncor2
|
||||||
|
- relion
|
||||||
|
- unblur
|
||||||
|
link_type: symlink
|
||||||
|
HDF5:
|
||||||
|
root: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/HDF5
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
^mpi: '{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
all: '{name}/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
~mpi: '{name}_serial/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
threads=openmp: '{name}_OMP/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
select:
|
||||||
|
- alps
|
||||||
|
- h5hut+mpi
|
||||||
|
- hdf5-blosc
|
||||||
|
- ioapi
|
||||||
|
- hdf5+mpi
|
||||||
|
- netcdf-c
|
||||||
|
- netcdf-fortran
|
||||||
|
- netcdf-c
|
||||||
|
- trilinos
|
||||||
|
link_type: symlink
|
||||||
|
HDF5_serial:
|
||||||
|
root: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/HDF5_serial
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
^mpi: '{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
all: '{name}/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
~mpi: '{name}_serial/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
threads=openmp: '{name}_OMP/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
select:
|
||||||
|
- hdf5~mpi
|
||||||
|
- h5hut~mpi
|
||||||
|
- ncview
|
||||||
|
link_type: symlink
|
||||||
|
Librairies:
|
||||||
|
root: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/Librairies
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
^mpi: '{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
all: '{name}/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
~mpi: '{name}_serial/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
threads=openmp: '{name}_OMP/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
select:
|
||||||
|
- alsa-lib
|
||||||
|
- gdrcopy
|
||||||
|
- giflib
|
||||||
|
- gmp
|
||||||
|
- hwloc
|
||||||
|
- isl
|
||||||
|
- knem
|
||||||
|
- libtasn1
|
||||||
|
- mpc
|
||||||
|
- mpfr
|
||||||
|
- nettle
|
||||||
|
- pmix
|
||||||
|
- ucx
|
||||||
|
- udunits
|
||||||
|
- wxwidgets
|
||||||
|
- x264
|
||||||
|
- zlib
|
||||||
|
link_type: symlink
|
||||||
|
MPI:
|
||||||
|
root: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/MPI
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
^mpi: '{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
all: '{name}/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
~mpi: '{name}_serial/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
threads=openmp: '{name}_OMP/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
select:
|
||||||
|
- amrex
|
||||||
|
- boxlib
|
||||||
|
- cp2k
|
||||||
|
- cpmd
|
||||||
|
- elegant
|
||||||
|
- elpa
|
||||||
|
- fftw
|
||||||
|
- gromacs
|
||||||
|
- lammps
|
||||||
|
- astra
|
||||||
|
link_type: symlink
|
||||||
|
MX:
|
||||||
|
root: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/MX
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
^mpi: '{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
all: '{name}/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
~mpi: '{name}_serial/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
threads=openmp: '{name}_OMP/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
select:
|
||||||
|
- cbflib
|
||||||
|
- lz4
|
||||||
|
- openbabel
|
||||||
|
- visit
|
||||||
|
link_type: symlink
|
||||||
|
Programming:
|
||||||
|
root: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/Programming
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
^mpi: '{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
all: '{name}/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
~mpi: '{name}_serial/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
threads=openmp: '{name}_OMP/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
select:
|
||||||
|
- autoconf
|
||||||
|
- automake
|
||||||
|
- binutils
|
||||||
|
- bison
|
||||||
|
- cmake
|
||||||
|
- erlang
|
||||||
|
- gcc
|
||||||
|
- go
|
||||||
|
- intel
|
||||||
|
- openjdk
|
||||||
|
- julia
|
||||||
|
- libtool
|
||||||
|
- lua
|
||||||
|
- m4
|
||||||
|
- nasm
|
||||||
|
- perl
|
||||||
|
- nvhpc+mpi
|
||||||
|
- python
|
||||||
|
- py-tensorflow
|
||||||
|
- qt
|
||||||
|
- r
|
||||||
|
- tcl
|
||||||
|
- tk
|
||||||
|
link_type: symlink
|
||||||
|
System:
|
||||||
|
root: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/System
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
^mpi: '{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
all: '{name}/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
~mpi: '{name}_serial/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
threads=openmp: '{name}_OMP/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
select:
|
||||||
|
- bash
|
||||||
|
- filebench
|
||||||
|
- ior
|
||||||
|
- mdtest
|
||||||
|
- nmap
|
||||||
|
- patchelf
|
||||||
|
- unison
|
||||||
|
link_type: symlink
|
||||||
|
Tools:
|
||||||
|
root: /afs/psi.ch/sys/spack-rhel7/Tools
|
||||||
|
projections:
|
||||||
|
^mpi: '{name}/{version}/{^mpi.name}/{^mpi.version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
all: '{name}/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
~mpi: '{name}_serial/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
threads=openmp: '{name}_OMP/{version}/{compiler.name}/{compiler.version}'
|
||||||
|
select:
|
||||||
|
- aria2
|
||||||
|
- asciidoc
|
||||||
|
- coreutils
|
||||||
|
- emacs
|
||||||
|
- ffmpeg
|
||||||
|
- gaussian
|
||||||
|
- gettext
|
||||||
|
- git
|
||||||
|
- global
|
||||||
|
- gnupg
|
||||||
|
- gnuplot
|
||||||
|
- gnutls
|
||||||
|
- hdfview
|
||||||
|
- krb5
|
||||||
|
- kubernetes
|
||||||
|
- namd
|
||||||
|
- ncview
|
||||||
|
- openjpeg
|
||||||
|
- openssl
|
||||||
|
- orca
|
||||||
|
- paraview
|
||||||
|
- texlive
|
||||||
|
- tmux
|
||||||
|
- uncrustify
|
||||||
|
- vim
|
||||||
|
- visit
|
||||||
|
- xmlto
|
||||||
|
- xz
|
||||||
|
link_type: symlink
|
||||||
93
env/merlin/all/sysconfigs/compilers.yaml
vendored
Normal file
93
env/merlin/all/sysconfigs/compilers.yaml
vendored
Normal file
@ -0,0 +1,93 @@
|
|||||||
|
---
|
||||||
|
compilers:
|
||||||
|
- compiler:
|
||||||
|
environment: {}
|
||||||
|
extra_rpaths: []
|
||||||
|
flags: {}
|
||||||
|
modules: []
|
||||||
|
operating_system: rhel7
|
||||||
|
paths:
|
||||||
|
cc: /opt/psi/Programming/intel/22.2/compiler/2022.1.0/linux/bin/icx
|
||||||
|
cxx: /opt/psi/Programming/intel/22.2/compiler/2022.1.0/linux/bin/dpcpp
|
||||||
|
f77: /opt/psi/Programming/intel/22.2/compiler/2022.1.0/linux/bin/ifx
|
||||||
|
fc: /opt/psi/Programming/intel/22.2/compiler/2022.1.0/linux/bin/ifx
|
||||||
|
spec: dpcpp@2022.1.0
|
||||||
|
target: x86_64
|
||||||
|
- compiler:
|
||||||
|
environment: {}
|
||||||
|
extra_rpaths: []
|
||||||
|
flags: {}
|
||||||
|
modules: []
|
||||||
|
operating_system: rhel7
|
||||||
|
paths:
|
||||||
|
cc: /opt/psi/Programming/intel/22.2/compiler/2022.1.0/linux/bin/intel64/icc
|
||||||
|
cxx: /opt/psi/Programming/intel/22.2/compiler/2022.1.0/linux/bin/intel64/icpc
|
||||||
|
f77: /opt/psi/Programming/intel/22.2/compiler/2022.1.0/linux/bin/intel64/ifort
|
||||||
|
fc: /opt/psi/Programming/intel/22.2/compiler/2022.1.0/linux/bin/intel64/ifort
|
||||||
|
spec: intel@2021.6.0
|
||||||
|
target: x86_64
|
||||||
|
- compiler:
|
||||||
|
environment: {}
|
||||||
|
extra_rpaths: []
|
||||||
|
flags: {}
|
||||||
|
modules: []
|
||||||
|
operating_system: rhel7
|
||||||
|
paths:
|
||||||
|
cc: /opt/psi/Programming/intel/22.2/compiler/2022.1.0/linux/bin/icx
|
||||||
|
cxx: /opt/psi/Programming/intel/22.2/compiler/2022.1.0/linux/bin/icpx
|
||||||
|
f77: /opt/psi/Programming/intel/22.2/compiler/2022.1.0/linux/bin/ifx
|
||||||
|
fc: /opt/psi/Programming/intel/22.2/compiler/2022.1.0/linux/bin/ifx
|
||||||
|
spec: oneapi@2022.1.0
|
||||||
|
target: x86_64
|
||||||
|
- compiler:
|
||||||
|
environment: {}
|
||||||
|
extra_rpaths: []
|
||||||
|
flags: {}
|
||||||
|
modules: []
|
||||||
|
operating_system: rhel7
|
||||||
|
paths:
|
||||||
|
cc: /opt/psi/Programming/gcc/8.3.0/bin/gcc
|
||||||
|
cxx: /opt/psi/Programming/gcc/8.3.0/bin/g++
|
||||||
|
f77: /opt/psi/Programming/gcc/8.3.0/bin/gfortran
|
||||||
|
fc: /opt/psi/Programming/gcc/8.3.0/bin/gfortran
|
||||||
|
spec: gcc@8.3.0
|
||||||
|
target: x86_64
|
||||||
|
- compiler:
|
||||||
|
environment: {}
|
||||||
|
extra_rpaths: []
|
||||||
|
flags: {}
|
||||||
|
modules: []
|
||||||
|
operating_system: rhel7
|
||||||
|
paths:
|
||||||
|
cc: /opt/psi/Programming/gcc/12.1.0/bin/gcc
|
||||||
|
cxx: /opt/psi/Programming/gcc/12.1.0/bin/g++
|
||||||
|
f77: /opt/psi/Programming/gcc/12.1.0/bin/gfortran
|
||||||
|
fc: /opt/psi/Programming/gcc/12.1.0/bin/gfortran
|
||||||
|
spec: gcc@12.1.0
|
||||||
|
target: x86_64
|
||||||
|
- compiler:
|
||||||
|
environment: {}
|
||||||
|
extra_rpaths: []
|
||||||
|
flags: {}
|
||||||
|
modules: []
|
||||||
|
operating_system: rhel7
|
||||||
|
paths:
|
||||||
|
cc: /opt/psi/Programming/clang/12.0.0_rhel7/bin/clang
|
||||||
|
cxx: /opt/psi/Programming/clang/12.0.0_rhel7/bin/clang++
|
||||||
|
f77: null
|
||||||
|
fc: null
|
||||||
|
spec: clang@12.0.0
|
||||||
|
target: x86_64
|
||||||
|
- compiler:
|
||||||
|
environment: {}
|
||||||
|
extra_rpaths: []
|
||||||
|
flags: {}
|
||||||
|
modules: []
|
||||||
|
operating_system: rhel7
|
||||||
|
paths:
|
||||||
|
cc: /opt/psi/Programming/pgi/21.5/Linux_x86_64/21.5/compilers/bin/nvc
|
||||||
|
cxx: /opt/psi/Programming/pgi/21.5/Linux_x86_64/21.5/compilers/bin/nvc++
|
||||||
|
f77: /opt/psi/Programming/pgi/21.5/Linux_x86_64/21.5/compilers/bin/nvfortran
|
||||||
|
fc: /opt/psi/Programming/pgi/21.5/Linux_x86_64/21.5/compilers/bin/nvfortran
|
||||||
|
spec: nvhpc@21.5
|
||||||
|
target: x86_64
|
||||||
6
env/merlin/all/sysconfigs/config.yaml
vendored
Normal file
6
env/merlin/all/sysconfigs/config.yaml
vendored
Normal file
@ -0,0 +1,6 @@
|
|||||||
|
config:
|
||||||
|
build_stage:
|
||||||
|
- /scratch/spack-rhel7
|
||||||
|
install_tree:
|
||||||
|
root: /scratch/spack-rhel7/spack-install
|
||||||
|
source_cache: /scratch/spack-rhel7/spack/var/spack/cache
|
||||||
287
env/merlin/all/sysconfigs/packages.yaml
vendored
Normal file
287
env/merlin/all/sysconfigs/packages.yaml
vendored
Normal file
@ -0,0 +1,287 @@
|
|||||||
|
---
|
||||||
|
packages:
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
compiler:
|
||||||
|
- gcc@12.1.0
|
||||||
|
permissions:
|
||||||
|
read: user
|
||||||
|
write: user
|
||||||
|
target:
|
||||||
|
- haswell
|
||||||
|
providers:
|
||||||
|
pkgconfig: [pkg-config]
|
||||||
|
binutils:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: binutils@2.38
|
||||||
|
bzip2:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: bzip2@1.0.6
|
||||||
|
cpio:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: cpio@2.11
|
||||||
|
curl:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: curl@7.29.0
|
||||||
|
cvs:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: cvs@1.11.23
|
||||||
|
diffutils:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: diffutils@3.3
|
||||||
|
doxygen:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: doxygen@1.8.5
|
||||||
|
expat:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: expat@1.6.0
|
||||||
|
file:
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: file@5.11
|
||||||
|
findutils:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: findutils@4.5.11
|
||||||
|
flex:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: flex@2.5.37+lex
|
||||||
|
# E.G: only available from already downloaded source, so I put it here
|
||||||
|
gams:
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /opt/psi/Tools/GAMS/31.1.1/gams31.1_linux_x64_64_sfx
|
||||||
|
spec: gams@31.1.1
|
||||||
|
gawk:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: gawk@4.0.2
|
||||||
|
ghostscript:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: ghostscript@9.25
|
||||||
|
git:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: git@1.8.3.1~tcltk
|
||||||
|
glew:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: glew@1.10.0
|
||||||
|
gmake:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: gmake@3.82
|
||||||
|
groff:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: groff@1.22.2
|
||||||
|
hcoll:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /opt/mellanox/hcoll
|
||||||
|
spec: hcoll@3.9.1927
|
||||||
|
fftw:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: fftw@3.3.3
|
||||||
|
intel-oneapi-mkl:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /opt/psi/Programming/intel/22.2
|
||||||
|
spec: intel-oneapi-mkl@2022.1.0
|
||||||
|
intel-oneapi-mpi:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /opt/psi/Programming/intel/22.2
|
||||||
|
spec: intel-oneapi-mpi@2021.6.0
|
||||||
|
libcroco:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: libcroco@0.6.13
|
||||||
|
libevent:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: libevent@2.0
|
||||||
|
libfabric:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: libfabric@1.10.2
|
||||||
|
libfuse:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: libfuse@3.6.1
|
||||||
|
libice:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: libice@6.3.0
|
||||||
|
libjpeg-turbo:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: libjpeg-turbo@62.1.0
|
||||||
|
libpthread:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: libpthread@2.17
|
||||||
|
libpthread-stubs:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: libpthread-stubs@0.4
|
||||||
|
libreadline:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: libreadline@6.2
|
||||||
|
libtiff:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: libtiff@5.2.0
|
||||||
|
libx11:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: libx11@6.3.0
|
||||||
|
libxext:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: libxext@6.4.0
|
||||||
|
libxft:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: libxft@2.3.2
|
||||||
|
libxpm:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: libxpm@4.11.0
|
||||||
|
libxt:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: libxt@6.0.0
|
||||||
|
m4:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: m4@1.4.16
|
||||||
|
# E.G: only available from already downloaded source, so I put it here
|
||||||
|
mxm:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /opt/psi/System/mxm/3.6.3104
|
||||||
|
spec: mxm@3.6.3104
|
||||||
|
ncurses:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: ncurses@5.9.20130511
|
||||||
|
nlohmann-json:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: nlohmann-json@3.10.5
|
||||||
|
numactl:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: numactl@2.0.14
|
||||||
|
openssh:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: openssh@7.4p1
|
||||||
|
openssl:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: openssl@1.0.2k-fips
|
||||||
|
pcre:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: pcre@8.32
|
||||||
|
pkg-config:
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||||||
|
buildable: false
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||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
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||||||
|
spec: pkg-config@0.27.1
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||||||
|
rsync:
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||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: rsync@3.1.2
|
||||||
|
ruby:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: ruby@2.0.0p648
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||||||
|
sed:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: sed@4.2.2
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||||||
|
sqlite:
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||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: sqlite@3.7.17
|
||||||
|
subversion:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: subversion@1.7.14
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||||||
|
tar:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: tar@1.26
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||||||
|
texinfo:
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||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: texinfo@5.1
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||||||
|
xerces-c:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: xerces-c@3.1
|
||||||
|
xz:
|
||||||
|
buildable: false
|
||||||
|
externals:
|
||||||
|
- prefix: /usr
|
||||||
|
spec: xz@5.2.2
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